Le Phragmite aquatique (Acrocephalus paludicola) est le passereau d’Europe continentale le plus menacé. Il est classé « vulnérable » dans la liste rouge mondiale de l’UICN (Union Internationale pour la Conservation de la Nature). Migrateur transsaharien, l’espèce transite de manière significative le long du littoral atlantique français au cours de sa migration post-nuptiale. Le long de ces côtes, la rive droite de l’estuaire de la Gironde est identifiée comme une des escales migratoires où l’espèce est contactée de manière significative tout au long du mois d’août. Compte-tenu du facteur déterminant des zones d’escales migratoires pour la conservation de l’espèce, BioSphère Environnement pilote sur les zones humides des rives de l'estuaire de la Gironde un programme visant à :

• Estimer les effectifs de migrants ;
• Étudier les temps de séjours ;
• Identifier les habitats exploités ;
• Définir la nature des ressources trophiques exploitées et exploitables.

La Gorgebleue à miroir de Nantes (Luscinia svecica namnetum) est un morphotype endémique de la façade atlantique française. En sus de son aire de répartition très limitée (concentrée de la baie de Douarnenez au bassin d’Arcachon), la faiblesse de ses effectifs associée à son instabilité démographique font peser sur le morphotype des risques d'extinction réels. La rive droite de l’estuaire de la Gironde est un espace fréquenté de manière significative par le morphotype en période de reproduction et en période post-nuptiale. La conservation des populations de Gorgebleue à miroir de Nantes implique le développement de connaissances fines relatives à l’écologie des populations, c'est pourquoi BioSphère Environnement pilote sur la rive droite de l'estuaire de la Gironde un programme visant à :

• Estimer les densités de reproducteurs ;
• Identifier la typologie des habitats exploités par le morphotype au cours de phases critiques de son cycle de vie (mue...) ;
• Définir la nature des ressources trophiques exploitées et exploitables.

Capacités d'accueil des espaces littoraux et arrières littoraux pour les limicoles

Le Courlis cendré (Numenius arquata) est le plus grand limicole d’Europe. Cette espèce est classée « quasi menacée » par l’UICN au niveau international, en raison d’une chute de ses populations en Europe et est classée « vulnérable » en France. Ce limicole en mauvais état de conservation au niveau européen est présent sur l’estuaire de la Gironde au cours des migrations pré et postnuptiales, ainsi qu’en période hivernale. Afin de définir les conditions de maintien des capacités d’accueil du Courlis cendré sur la rive droite de l'estuaire de la Gironde, BioSphère Environnement pilote sur cet espace un programme visant à :

• Estimer les effectifs d'hivernants ;
• Identifier la typologie d'habitats exploités par l'espèce ;
• Étudier les budgets d'activités sur différents espaces.

Utilisation des modèles de capture, marquage et recapture dans la compréhension des stratégies d’occupation spatiale des populations animales

BioSphère Environnement développe différents programmes intégrant des suivis par capture, marquage et recapture ou des suivis radio-télémétriques sur un large cortège d'espèces, permettant d'appréhender les paramètres démographiques des populations et de modéliser les stratégies d'occupation spatiale des individus ou populations. Les résultats de ces programmes présentent des intérêts tant en biologie de la conservation pour des espèces méritant un niveau de vigillance accru que pour des suivis relatifs à l'évaluation des risques de propagation de zoonoses : maladies, infections naturellement transmissible des animaux vertébrés à l'homme et inversement, telles que l'influenza aviaire.